國家自然科學獎、技術發明獎、科技進步獎一直是我國科研導向的風向標之一，以往這些獎項的評選所采取的是推薦方式，政府部門是推薦主體，專家學者和學術組織參與較少，行政色彩濃。

《方案》明確，今后科技獎勵的評選要改為提名制。科技部副部長黃衛表示，變“自薦”為“他薦”，這種方式，既可以評選出受到業界認可的科研項目、成果，也可以減少科研人員因為逐級申報而花費的大量“非科研”時間，“專家提名哪個（科研）項目可以獲獎，可以引導科研人員潛心研究，專注學術，遏制學術浮躁等一些不良的風氣。”

《方案》在提出適當提高國家科技獎獎勵標準的同時，還明確“要強化科技獎勵的榮譽性”，禁止以營利為目的使用國家科學技術獎進行營銷和宣傳。

此外，方案還出，對“拼湊“包裝”、游說評委”等行為一票否決；對造假、侵占他人成果等行為“零容忍”，黃衛表示，今后，要通過“健全科技獎勵誠信制度”，激發科技創新的更大活力，“要對涉及違規的科研成果采取一票否決、撤銷獎勵等措施，對違規責任人采取公開通報，階段性或者永久性參與國家科技獎活動的資格。”