11月法國制藥巨頭賽諾菲巴斯德承認，該公司生產的登革熱疫苗Dengvaxia可能存在安全隱患，“分析發現，從長期來看，對于那些從未感染過登革熱病毒的人群來說，在接種該疫苗后如果感染登革熱，可能引發更嚴重癥狀”。

賽諾菲巴斯德這則消息在菲律賓引發強烈震動，因從2016年起菲律賓大量采購這種疫苗，實施登革熱疫苗接種計劃，耗資35億比索，迄今已有超過70萬名兒童接種了這種疫苗。隨后有消息指出“問題疫苗”背后還可能隱藏著貪腐案件。

12月初，菲律賓司法部、衛生部、參議院相繼展開了對阿基諾政府批準的這個疫苗接種計劃的調查。

阿基諾表示，他2010年上臺后不久，時任衛生部長奧那向他提交了一份報告：全菲各地的登革熱病例數量大幅上升，全國有280萬人可能感染登革熱，該“問題疫苗”是在他的任內獲批準購入并大規模安排九歲以上兒童接種的。阿基諾為其政府的決定作出辯護，表示只是想要挽救生命，而且在疫苗大規模接種之前，政府遵守了所有法定程序。

菲律賓公共衛生專家稱，阿基諾政府批準的采用法國登革熱疫苗的接種計劃是菲律賓史上最大的丑聞，它利用政府資金、以藥物測試為目的、將臨床試驗偽裝成公共衛生計劃，此計劃的幕后決策者必須承擔法律責任。

事實上，除了法國登革熱疫苗接種計劃案，阿基諾卸任后至少還涉及另一宗官非。

今年7月14日，菲律賓調查官辦公室公布了一份長達35頁的調查報告，宣布下令以“篡奪職權”等罪名對前總統阿基諾、前警察總長普里西馬和前特警指揮官納皮納斯提起刑事指控。指控2015年初因三人指揮南部棉蘭老島馬一項抓捕恐怖分子的行動時“輕率魯莽”，導致44名特警死亡，要求追究他們的責任。